KRI Ahmad Yani mempunyai 2 pelancar umpan RL. Untuk penangkis jarak jauh KRI Ahmad Yani mampu dilengkapi dengan pemintas UA-8/9.

Sistem pertahanan udaranya pada asalnya adalah empat pelancar berkembar SAM Sea Cat, yang digantikan dengan 4 peluru berpandu permukaan-ke-udara Mistral dalam peluncur Simbad laras berkembar. Ia dikawal oleh sistem persenjataan kawalan SAM M-44.